Skema desain dan solusi rantai peptida polipeptida

I. Ringkasan
Peptida adalah makromolekul khusus yang urutannya tidak biasa dalam sifat kimia dan fisiknya.Beberapa peptida sulit disintesis, sementara peptida lainnya relatif mudah disintesis tetapi sulit dimurnikan.Masalah praktisnya adalah sebagian besar peptida sedikit larut dalam larutan air, jadi dalam pemurnian kita, bagian yang sesuai dari peptida hidrofobik harus dilarutkan dalam pelarut non-air. Oleh karena itu, pelarut atau buffer ini kemungkinan besar akan sangat tidak sesuai dengan penggunaannya. prosedur percobaan biologi, sehingga teknisi dilarang keras menggunakan peptida untuk keperluannya sendiri, sehingga berikut beberapa aspek perancangan peptida bagi peneliti.

Skema desain dan solusi rantai peptida polipeptida
Kedua, pemilihan peptida sulit sintetik yang tepat
1. Total panjang urutan yang diatur ke bawah
Peptida dengan residu kurang dari 15 lebih mudah diperoleh karena ukuran peptida bertambah dan kemurnian produk kasar menurun.Karena total panjang rantai peptida meningkat melebihi 20 residu, kuantitas produk yang tepat menjadi perhatian utama.Dalam banyak percobaan, mudah untuk mendapatkan efek yang tidak diharapkan dengan menurunkan jumlah residu di bawah 20.
2. Mengurangi jumlah residu hidrofobik
Peptida dengan dominasi residu hidrofobik yang besar, terutama di wilayah 7-12 residu dari terminal-C, biasanya menyebabkan kesulitan sintetik.Hal ini dipandang sebagai kombinasi yang tidak memadai justru karena lembaran lipatan B diperoleh dalam sintesis.“Dalam kasus seperti itu, mungkin berguna untuk mengubah lebih dari dua residu positif dan negatif, atau memasukkan Gly atau Pro ke dalam peptida untuk membuka kunci komposisi peptida.”
3. Penurunan regulasi terhadap residu yang “sulit”.
“Ada sejumlah residu Cys, Met, Arg, dan Try yang umumnya tidak mudah disintesis.”Ser biasanya akan digunakan sebagai alternatif nonoksidatif untuk Cys.
Skema desain dan solusi rantai peptida polipeptida

Ketiga, tingkatkan pilihan yang tepat untuk larut dalam air
1. Sesuaikan terminal N atau C
Sehubungan dengan peptida asam (yaitu, bermuatan negatif pada pH 7), asetilasi (asetilasi terminal-N, terminal C selalu mempertahankan gugus karboksil bebas) sangat disarankan untuk meningkatkan muatan negatif.Namun, untuk peptida basa (yaitu, bermuatan positif pada pH 7), aminasi (gugus amino bebas di ujung N dan aminasi di ujung C) sangat disarankan untuk meningkatkan muatan positif.

2. Memperpendek atau memperpanjang urutannya

Beberapa rangkaian mengandung sejumlah besar asam amino hidrofobik, seperti Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr dan Ala, dll. Bila residu hidrofobik ini melebihi 50%, biasanya tidak mudah larut.Mungkin berguna untuk memperpanjang urutan untuk lebih meningkatkan kutub positif dan negatif dari peptida.Opsi kedua adalah menurunkan regulasi ukuran rantai peptida untuk meningkatkan kutub positif dan negatif dengan menurunkan regulasi residu hidrofobik.Semakin kuat sisi positif dan negatif rantai peptida, semakin besar kemungkinannya untuk bereaksi dengan air.
3. Masukkan residu yang larut dalam air
Untuk beberapa rantai peptida, kombinasi beberapa asam amino positif dan negatif dapat meningkatkan kelarutan dalam air.Perusahaan kami merekomendasikan N-terminus atau C-terminus dari peptida asam untuk dikombinasikan dengan Glu-Glu.Terminal N atau C dari peptida dasar diberikan dan kemudian Lys-Lys.Jika grup bermuatan tidak dapat ditempatkan, Ser-Gly-Ser juga dapat ditempatkan di terminal N atau C.Namun, pendekatan ini tidak berhasil jika sisi rantai peptida tidak dapat diubah.