Peptida antimikroba ini awalnya berasal dari sistem pertahanan serangga, mamalia, amfibi, dll., dan terutama mencakup empat kategori:
1. cecropin awalnya terdapat dalam getah bening Cecropiamoth, yang terutama ditemukan pada serangga lain, dan peptida bakterisida serupa juga ditemukan di usus babi.Mereka biasanya dicirikan oleh daerah terminal-N yang sangat basa diikuti oleh fragmen hidrofobik yang panjang.
2. Peptida antimikroba Xenopus (magainin) berasal dari otot dan perut katak.Struktur peptida antimikroba xenopus juga ditemukan berbentuk heliks, terutama di lingkungan hidrofobik.Konfigurasi antipeptida xenopus dalam lapisan lipid dipelajari dengan NMR fase padat berlabel N.Berdasarkan pergeseran kimia resonansi asilamina, heliks antipeptida xenopus merupakan permukaan bilayer paralel, dan dapat menyatu membentuk sangkar berukuran 13 mm dengan struktur heliks periodik 30 mm.
3. Peptida pertahanan defensin berasal dari polimakrofag kelinci neutrofil polikariotik manusia dengan lobulus inti lengkap dan sel usus hewan.Sekelompok peptida antimikroba yang mirip dengan peptida pertahanan mamalia diekstraksi dari serangga, yang disebut “peptida pertahanan serangga”.Berbeda dengan peptida pertahanan mamalia, peptida pertahanan serangga hanya aktif melawan bakteri Gram positif.Bahkan peptida pertahanan serangga mengandung enam residu Cys, tetapi metode ikatan disulfida satu sama lain berbeda.Mode pengikatan jembatan disulfida intramolekul peptida antibakteri yang diekstraksi dari Drosophila melanogast mirip dengan peptida pertahanan tanaman.Dalam kondisi kristal, peptida pertahanan disajikan sebagai dimer.
4.Tachyplesin berasal dari kepiting tapal kuda yang disebut kepiting tapal kuda.Studi konfigurasi menunjukkan bahwa ia mengadopsi konfigurasi lipat B antiparalel (posisi 3-8, posisi 11-16), di manaβ-sudut dihubungkan satu sama lain (posisi 8-11), dan dua ikatan disulfida dihasilkan antara posisi 7 dan 12, dan antara posisi 3 dan 16.Dalam struktur ini, asam amino hidrofobik terletak di satu sisi bidang, dan enam residu kationik muncul di ekor molekul, sehingga strukturnya juga bersifat biofilik.
Oleh karena itu, hampir semua peptida antimikroba bersifat kationik, meskipun panjang dan tingginya bervariasi;Di kelas atas, baik dalam bentuk alfa-heliks atauβ- Struktur bitropik yang dapat dilipat merupakan ciri umum.
Waktu posting: 20 April-2023