Ada banyak jenis peptida transmembran, dan klasifikasinya didasarkan pada sifat fisik dan kimia, sumber, mekanisme konsumsi, dan aplikasi biomedis. Menurut sifat fisik dan kimianya, peptida penetrasi membran dapat dibagi menjadi tiga jenis: kationik, amphiphilic dan hidrofobik. Peptida membran kationik dan amphiphilic menyumbang 85%, sedangkan peptida membran hidrofobik hanya menyumbang 15%.
1. Peptida penembus membran kationik
Peptida transmembran kationik terdiri dari peptida pendek yang kaya akan arginin, lisin, dan histidin, seperti TAT, penetratin, polyarginine, p22n, dpv3 dan dpv6. Di antara mereka, arginin mengandung guanidine, yang dapat ikatan hidrogen dengan gugus asam fosfat bermuatan negatif pada membran sel dan memediasi peptida transmembran ke dalam membran di bawah kondisi nilai pH fisiologis. Studi oligarginin (dari 3 R hingga 12 R) menunjukkan bahwa kemampuan penetrasi membran hanya tercapai ketika jumlah arginin serendah 8, dan kemampuan penetrasi membran secara bertahap meningkat dengan meningkatnya jumlah arginin. Lisin, meskipun kationik seperti arginin, tidak mengandung guanidine, jadi ketika ada sendiri, efisiensi penetrasi membrannya tidak terlalu tinggi. Futaki et al. (2001) menemukan bahwa efek penetrasi membran yang baik hanya dapat dicapai ketika membran sel kationik, peptida yang menembus setidaknya 8 asam amino bermuatan positif. Meskipun residu asam amino bermuatan positif sangat penting untuk peptida penetratif untuk menembus membran, asam amino lainnya sama pentingnya, seperti ketika W14 bermutasi menjadi F, penetrabilitas penetratin hilang.
Kelas khusus peptida transmembran kationik adalah urutan lokalisasi nuklir (NLSS), yang terdiri dari peptida pendek yang kaya arginin, lisin dan prolin dan dapat diangkut ke nukleus melalui kompleks pori nuklir. NLSS dapat dibagi lebih lanjut menjadi pengetikan tunggal dan ganda, masing -masing terdiri dari satu dan dua kelompok asam amino basa. Sebagai contoh, PKKKRKV dari Simian Virus 40 (SV40) adalah NLS pengetikan tunggal, sedangkan protein nuklir adalah NLS pengetikan ganda. Krpaatkkagqakkkl adalah urutan pendek yang dapat berperan dalam transmembran membran. Karena sebagian besar NLS memiliki bilangan muatan kurang dari 8, NLS tidak peptida transmembran yang efektif, tetapi mereka dapat menjadi peptida transmembran yang efektif ketika terkait secara kovalen dengan sekuens peptida hidrofobik untuk membentuk peptida transmembran amphiphilic.
2. Peptida transmembran amphiphilic
Peptida transmembran amphiphilic terdiri dari domain hidrofilik dan hidrofobik, yang dapat dibagi menjadi amphiphilic α-helical amphiphilic, β-lipat amphiphilic dan prolin sekunder, dan prolin.
Jenis primer peptida membran keausan amfiphilic ke dalam dua kategori, kategori dengan NLSS secara kovalen dihubungkan oleh urutan peptida hidrofobik, seperti mpg (glaflgflgaagstmgawsqpkkrkv, pep -1 noCleRization poCleRization pepwwetwtewsqpkkv), keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya pada keduanya. yang domain hidrofobik MPG terkait dengan urutan fusi glikoprotein HIV 41 (galflgflgaagstmg a), dan domain hidrofobik Pep-1 terkait dengan kluster kaya tryptophan dengan afinitas membran tinggi (Ketwet Wwtew). Namun, domain hidrofobik keduanya terhubung dengan sinyal lokalisasi nuklir PKKKRKV melalui WSQP. Kelas lain dari peptida transmembran amphiphilic primer diisolasi dari protein alami, seperti PVEC, ARF (1-22) dan BPRPR (1-28).
Peptida transmembran α-heliks sekunder mengikat membran melalui α-heliks, dan residu asam amino hidrofilik dan hidrofobiknya terletak pada permukaan yang berbeda dari struktur heliks, seperti MAP (Klalklalk alkaalkla). For beta peptide folding type amphiphilic wear membrane, its ability to form a beta pleated sheet is crucial to its penetration ability of the membrane, such as in VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) in the process of researching the penetration ability of the membrane, using the type D - amino acid mutation analogues could not form beta folded piece, the Kemampuan penetrasi membran sangat buruk. Dalam prolin yang diperkaya dengan peptida transmembran amfifilik, polyproline II (PPII) mudah terbentuk dalam air murni ketika prolin sangat diperkaya dalam struktur polipeptida. PPII adalah heliks kidal dengan residu asam amino 3.0 per giliran, yang bertentangan dengan struktur alpha-helix tangan kanan standar dengan 3,6 residu asam amino per giliran. Peptida transmembran amphiphilic yang diperkaya prolin termasuk peptida antimikroba sapi 7 (BAC7), sintetis polipeptida (PPR) N (n dapat 3, 4, 5 dan 6), dll.
3. Peptida penembus membran hidrofobik
Peptida transmembran hidrofobik hanya mengandung residu asam amino non-polar, dengan muatan bersih kurang dari 20% dari total muatan urutan asam amino, atau mengandung gugus hidrofobik atau kelompok kimia yang penting untuk transmembran. Meskipun peptida transmembran seluler ini sering diabaikan, mereka memang ada, seperti faktor pertumbuhan fibroblast (K-FGF) dan faktor pertumbuhan fibroblast 12 (F-GF12) dari sarkoma Kaposi.
Waktu posting: 2025-07-01