Peptida penembus sel adalah peptida kecil yang dapat dengan mudah menembus membran sel. Kelas molekul ini, terutama CPP dengan fungsi penargetan, menjanjikan pengiriman obat yang efisien ke sel target.
Oleh karena itu, penelitian tentang itu memiliki signifikansi biomedis tertentu. Dalam penelitian ini, CPPs dengan aktivitas transmembran yang berbeda dipelajari pada tingkat urutan, mencoba mencari tahu faktor -faktor yang mempengaruhi aktivitas transmembran CPP, perbedaan urutan antara CPP dengan aktivitas dan nonCPP yang berbeda, dan memperkenalkan metode untuk menganalisis urutan biologis.
Urutan CPP dan nonCPPS diperoleh dari database CPPSite dan literatur yang berbeda, dan peptida transmembran (HCPPS, MCPPS, LCPPs) dengan aktivitas transmembran tinggi, sedang, dan rendah diekstraksi dari sekuens CPP untuk membangun set data. Berdasarkan set data ini, studi berikut dilakukan:
1, asam amino dan komposisi struktur sekunder dari berbagai CPP dan nonCPP aktif yang berbeda dianalisis dengan ANOVA. Ditemukan bahwa interaksi elektrostatik dan hidrofobik dari asam amino memainkan peran penting dalam aktivitas transmembran CPP, dan struktur heliks dan coiling acak juga mempengaruhi aktivitas transmembran CPP.
2. Sifat fisik dan kimia dan panjang CPP dengan berbagai aktivitas ditampilkan pada bidang dua dimensi. Ditemukan bahwa CPP dan nonCPP dengan berbagai kegiatan dapat dikelompokkan di bawah beberapa properti khusus, dan HCPP, MCPP, LCPP dan nonCPP dibagi menjadi tiga cluster, menunjukkan perbedaan mereka;
3. Dalam makalah ini, konsep centroid fisik dan kimia dari urutan biologis diperkenalkan, dan residu yang menyusun urutan dianggap sebagai titik partikel, dan urutannya disarikan sebagai sistem partikel untuk penelitian. Metode ini diterapkan pada analisis CPP dengan memproyeksikan CPP dengan berbagai aktivitas ke bidang 3D dengan metode PCA, dan ditemukan bahwa sebagian besar CPPs dikelompokkan bersama dan beberapa LCPPs dikelompokkan bersama dengan nonCPP.
Studi ini memiliki implikasi untuk desain CPP dan memahami perbedaan dalam urutan CPP dengan kegiatan yang berbeda. Selain itu, metode analisis centroid fisik dan kimia dari sekuens biologis yang diperkenalkan dalam makalah ini juga dapat digunakan untuk analisis masalah biologis lainnya. Pada saat yang sama, mereka dapat digunakan sebagai parameter input untuk beberapa masalah klasifikasi biologis dan berperan dalam pengenalan pola.
Waktu posting: 2025-07-02