Peptida penembus sel adalah peptida kecil yang dapat dengan mudah menembus membran sel.Kelas molekul ini, terutama CPP dengan fungsi penargetan, menjanjikan pengiriman obat yang efisien ke sel target.
Oleh karena itu, penelitian mengenai hal tersebut memiliki signifikansi biomedis tertentu.Dalam penelitian ini, CPP dengan aktivitas transmembran berbeda dipelajari pada tingkat sekuens, mencoba mengetahui faktor-faktor yang mempengaruhi aktivitas transmembran CPP, perbedaan sekuens antara CPP dengan aktivitas berbeda dan NonCPP, dan memperkenalkan metode untuk menganalisis sekuens biologis.
Urutan CPP dan NonCPP diperoleh dari database situs CPP dan literatur yang berbeda, dan peptida transmembran (HCPP, MCPP, LCPP) dengan aktivitas transmembran tinggi, sedang, dan rendah diekstraksi dari urutan CPP untuk membuat kumpulan data.Berdasarkan kumpulan data ini, penelitian berikut dilakukan:
1, Komposisi asam amino dan struktur sekunder dari CPP aktif dan NonCPP yang berbeda dianalisis dengan ANOVA.Ditemukan bahwa interaksi elektrostatik dan hidrofobik asam amino memainkan peran penting dalam aktivitas transmembran CPP, dan struktur heliks serta penggulungan acak juga mempengaruhi aktivitas transmembran CPP.
2. Sifat fisik dan kimia serta panjang CPP dengan aktivitas berbeda ditampilkan pada bidang dua dimensi.Ditemukan bahwa CPP dan NonCPP dengan aktivitas berbeda dapat dikelompokkan dalam beberapa properti khusus, dan HCPP, MCPP, LCPP, dan NonCPP dibagi menjadi tiga kelompok, yang menunjukkan perbedaannya;
3. Dalam makalah ini, konsep pusat fisik dan kimia dari rangkaian biologis diperkenalkan, dan residu yang menyusun rangkaian tersebut dianggap sebagai titik partikel, dan rangkaian tersebut diabstraksi sebagai sistem partikel untuk penelitian.Metode ini diterapkan pada analisis CPP dengan memproyeksikan CPP dengan aktivitas berbeda ke bidang 3D dengan metode PCA, dan ditemukan bahwa sebagian besar CPP mengelompok bersama dan beberapa LCPP mengelompok bersama dengan NonCPP.
Penelitian ini berimplikasi pada perancangan CPP dan pemahaman perbedaan rangkaian CPP dengan aktivitas yang berbeda.Selain itu, metode analisis pusat fisika dan kimia sekuens biologis yang diperkenalkan dalam makalah ini juga dapat digunakan untuk analisis masalah biologis lainnya.Pada saat yang sama, mereka dapat digunakan sebagai parameter masukan untuk beberapa masalah klasifikasi biologis dan berperan dalam pengenalan pola.
Waktu posting: 15 Juni 2023