Di permukaan, pembentukan ikatan peptida, menghasilkan dipeptida, adalah proses kimia sederhana.Artinya kedua komponen asam amino dihubungkan oleh ikatan peptida, ikatan Amida, saat mengalami dehidrasi.
Pembentukan ikatan peptida adalah aktivasi asam amino dalam kondisi reaksi ringan.(A) gugus karboksil, asam amino kedua (B) Gugus karboksil teraktivasi nukleofilik kemudian membentuk dipeptida (AB).“Jika komponen karboksil (A) tidak terlindungi, maka pembentukan ikatan peptida tidak dapat dikendalikan.”Produk sampingan seperti peptida linier dan siklik dapat dicampur dengan senyawa target AB.Oleh karena itu, semua gugus fungsi yang tidak terlibat dalam pembentukan ikatan peptida harus dilindungi secara reversibel sementara selama sintesis peptida.
Jadi, sintesis peptida – pembentukan setiap ikatan peptida – melibatkan tiga langkah agregasi.
Langkah pertama adalah menyiapkan beberapa asam amino yang memerlukan perlindungan, dan struktur asam amino zwitterionik sudah tidak ada lagi.
Langkah kedua adalah reaksi dua langkah untuk membentuk ikatan peptida, di mana gugus karboksil dari asam amino yang dilindungi N pertama-tama diaktivasi menjadi zat antara aktif dan kemudian ikatan peptida terbentuk.Reaksi berpasangan ini dapat terjadi sebagai reaksi satu langkah atau sebagai dua reaksi berurutan.
Langkah ketiga adalah penghapusan selektif atau penghapusan lengkap dasar pelindung.Meskipun seluruh penghilangan hanya dapat terjadi setelah semua rantai peptida telah tersusun, penghilangan gugus pelindung secara selektif juga diperlukan untuk melanjutkan sintesis peptida.
Karena 10 asam amino (Ser, Thr, Tyr, Asp, Glu, Lys, Arg, His, Sec dan Cys) mengandung gugus fungsi rantai samping, yang memerlukan perlindungan selektif, sehingga sintesis peptida menjadi lebih rumit.Basis proteksi sementara dan semi permanen harus dibedakan karena persyaratan selektivitas yang berbeda.Gugus proteksi sementara digunakan pada langkah berikutnya untuk mencerminkan proteksi sementara gugus fungsi asam amino atau karboksil.Gugus pelindung semi permanen dihilangkan tanpa mengganggu ikatan peptida atau rantai samping asam amino yang sudah terbentuk, terkadang selama sintesis.
“Idealnya, aktivasi komponen karboksil dan pembentukan ikatan peptida selanjutnya (reaksi penggandengan) harus berlangsung cepat, tanpa pembentukan rasemat atau produk sampingan, dan reaktan molar harus diterapkan untuk mencapai hasil yang tinggi.”Sayangnya, tidak ada metode penggabungan kimia yang memenuhi persyaratan ini, dan hanya sedikit yang cocok untuk sintesis praktis.
Selama sintesis peptida, gugus fungsi yang terlibat dalam berbagai reaksi biasanya dihubungkan ke pusat manual, satu-satunya pengecualian adalah glisin, dan terdapat potensi risiko rotasi.
Langkah terakhir dalam siklus sintesis peptida adalah penghilangan semua gugus pelindung.Penghapusan selektif gugus pelindung penting untuk perluasan rantai peptida selain persyaratan untuk menghilangkan perlindungan sepenuhnya dalam sintesis dipeptida.Strategi sintetik harus direncanakan dengan hati-hati.Tergantung pada pilihan strategisnya, N dapat secara selektif menghilangkan gugus pelindung α-amino atau karboksil.Istilah “strategi” mengacu pada urutan reaksi kondensasi masing-masing asam amino.Secara umum, terdapat perbedaan antara sintesis bertahap dan kondensasi fragmen.Sintesis peptida (juga dikenal sebagai “sintesis konvensional”) terjadi dalam larutan.Dalam kebanyakan kasus, pemanjangan rantai peptida secara bertahap hanya dapat disintesis dengan menggunakan rantai peptida untuk mensintesis fragmen yang lebih pendek.Untuk mensintesis peptida yang lebih panjang, molekul target harus disegmentasi menjadi fragmen yang sesuai dan ditentukan bahwa molekul tersebut dapat meminimalkan derajat diferensiasi pada ujung C.Setelah masing-masing fragmen dirakit secara bertahap, senyawa target akan digabungkan.Strategi sintesis peptida mencakup pemilihan fragmen pelindung terbaik dan paling tepat, dan strategi sintesis peptida mencakup pemilihan kombinasi basa pelindung yang paling tepat dan metode konjugasi fragmen terbaik.
Waktu posting: 19 Juli-2023